菌种鉴定

菌种鉴定菌种鉴定有多种方法,而通过dna测序鉴定的方法被誉为金标准。dna 测序进行菌种鉴定的结果比传统生化鉴定更为直接,鉴定结果也更为可靠。
核糖体rna(rrna)是生物细胞中主要的核糖核酸之一。rrna分子的一级结构既具有高度保守性区域,又具有高度变化特异性区域。保守区域反映了生物物种间的亲缘关系,可用于构建生命统一进化树,而高度变化特异区域则能表明物种间的差异,可用于区别属或种。

服务内容

1. 16s rrna

16s rrna位于原核细胞核糖体小亚基上,是细菌分类学研究中最常用的”分子钟”,其序列包含10个保守区域和9个高度变化特异性。其中保守区在细菌间差异不大,高度变化性特异性区域具有属或种的特异性,序列则随菌间的亲缘关系不同而有一定的差异。因此,16s rrna基因是能揭示生物物种的特征核酸序列,被认为是最适用于细菌系统发育和分类鉴定的指标。

16s rdna基因测序,通常是选择某个或某几个变异区域,选择通用引物进行扩增成pcr产物,然后进行测序分析和菌种鉴定。通过检测16s rdna的序列变异和丰度,可以了解环境样品中群落多样性信息。基于16s rdna的分析在微生物分类鉴定,微生态研究等方面起到重要作用。

2. 18s rdna或its(internal transcribed spacer)

18s rdna和its被广泛应用在真菌分类鉴定中。18s rdna在系统发育研究中较适用于种级以上阶元的分类。its属于中度保守的区域,利用它可研究种及种以下的分类阶元。

服务优势

  1. 结果准确可靠:严格控制交叉污染,测序信号准确可靠。
  2. 经验丰富:多种引物组合结合强大的基因组提取和pcr扩增能力,具有丰富的经验可以解决扩增或测序失败等难题。

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